První písemná zmínka o Frymburku je z roku 1277. Původně náležel pánům z Krumlova a po roce 1302 Rožmberkům. Původně trhové městečko s plátenickou tradicí z konce 13. století leželo na obchodní stezce z Horního Rakouska do Čech. Rožmberkové zřídili u mostu přes Vltavu mýto zmiňované již roku 1305. Městečkem je od roku 1379.
Die erste schriftliche Erwähnung über Frymburk stammt aus dem Jahre 1277. Ursprünglich gehörte es den Herren von Krumlov und nach dem Jahre 1302 den Rosenbergern. Frymburk war ursprünglich seit dem Ende des 13.Jahrhundert ein kleines Marktstädtchen mit traditioneller Leinenproduktion. Es lag am Handelssweg zwischen Oberösterreich und Böhmen. Die Rosenberger führten hier schon im Jahre 1305 an der Brücke über Moldau eine Mautgebühr ein. Im Jahre 1379 wurde es zur Stadt erhoben.
Frymburský hřbitov byl zatopen Lipenskou přehradou a ostatky přeneseny na nový hřbitov na jihovýchodním okraji obce.
Der Friedhof war überflutet wegen dem Lipno Staudamm, die Reste wurden auf den neuen Friedhof am südöstlichen Rande des Dorfes übertragen.
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